DOCUMENTATION

Vous trouverez plus d'informations sur Vina-GPU ici.

Pour l'utiliser, il faut charger le module correspondant à la version souhaitée :

module load Vina-GPU/Vina-GPU.gcc10.cuda11.6

Voici un exemple de script pour lancer une simulation avec Vina-GPU sur un nœud complet avec 1 GPU (Vina-GPU ne semble pas fonctionner sur plus d'un GPU à la fois pour le moment) :

#!/bin/bash

#SBATCH -p publicgpu
#SBATCH -N 1 # Réservation de 1 noeud
#SBATCH --gres=gpu:1 # 1 GPU

module load Vina-GPU/Vina-GPU.gcc10.cuda11.6

INFILE=chemin/vers/votre/config.txt

cd $VINAROOT # Le programme ne semble s'exécuter correctement qu'à partir de son répertoire d'installation

ulimit -s 8192 # Il faut au minimum 8M de stack

./Vina-GPU --config $INFILE # Note : vous n'êtes pas obligé d'utiliser une variable pour le fichier d'entrée

VERSIONS ET SCRIPTS D'INSTALLATION

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